Регулирования процесса свертывания крови осуществляют так называемые первичные физиологические антикоагулянты, которые связывают и инактивируют энзимы коагуляционного каскада. Физиологические антикоагулянты позволяют локализовать свертывание в месте повреждения сосудистой стенки и предупредить превращение процесса в системный.
Наиболее значимыми физиологическими антикоагулянтами являются антитромбин (III) и система протеина С.